بنى مسجد الفاتح بواسطة محمد الفاتح بعد فتح اسطنبول . و قام ببناء المسجد على قمة التل فوق أنقاض كنيسة الرسل ومقابر أباطرة القسطنطينية و بيزنطة . وقد اصبح المسجد من الاماكن المهمة حيث اختار محمد الفاتح ان يدفن هناك . . ضم المسجد الاصلى مدرسة اسلامية و مكانا لاقامة عابرى السبيل و خان قديم . و لسوء الحظ, فقد تسببت هزة أرضية فى هدم المسجد الاصلى سنة 1766 الذى بناه محمد الفاتح ثم اعيد بناؤه فى الفترة مابين 1767-1771